MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 2

Total Repeats: 11134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010676	GGAAT	2	10	45	54	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010676	GGC	2	6	59	64	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010676	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010676	TTC	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010676	CGA	2	6	145	150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010676	CCA	2	6	155	160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010676	ACA	2	6	197	202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010676	GAAAT	2	10	490	499	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010676	GCG	2	6	503	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010676	GCCG	2	8	523	530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010676	GT	3	6	539	544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010676	GCCG	2	8	602	609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010676	CGA	2	6	611	616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010676	C	6	6	636	641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_010676	GC	3	6	999	1004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010676	GCCTC	2	10	1018	1027	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_010676	GCAG	2	8	1577	1584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010676	GCG	3	9	1711	1719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010676	TC	3	6	3885	3890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010676	TGTT	2	8	5922	5929	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010676	GCC	3	9	5970	5978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010676	CG	3	6	5988	5993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010676	CGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010676	CCAT	2	8	6015	6022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010676	TAA	2	6	6034	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010676	GC	3	6	6056	6061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010676	GGC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010676	CG	3	6	6192	6197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010676	CGTT	2	8	6791	6798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010676	GA	3	6	6820	6825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010676	GCG	2	6	7284	7289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010676	CG	3	6	7300	7305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010676	CGC	2	6	7325	7330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010676	GTT	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010676	CCA	2	6	7365	7370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010676	TCC	2	6	7371	7376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010676	CAT	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010676	CAGC	2	8	7414	7421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010676	TAGGA	2	10	7460	7469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010676	AATC	2	8	7470	7477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010676	GCC	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010676	CTC	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010676	GC	3	6	9547	9552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010676	CGA	2	6	9601	9606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010676	TG	3	6	9628	9633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010676	CGC	2	6	9724	9729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010676	AAC	2	6	14511	14516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010676	GT	3	6	20071	20076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010676	CG	4	8	20079	20086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010676	CG	3	6	20091	20096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010676	AAG	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010676	GTCT	2	8	20158	20165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010676	CG	3	6	20191	20196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010676	GCG	2	6	20206	20211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010676	TCGG	2	8	20232	20239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010676	CGC	2	6	20298	20303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010676	CGG	2	6	20369	20374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010676	AC	4	8	20393	20400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010676	TAAA	2	8	20441	20448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010676	GAT	2	6	20470	20475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010676	GCC	2	6	21024	21029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010676	ATC	2	6	22256	22261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010676	GCG	2	6	22270	22275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010676	CA	3	6	22301	22306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010676	GCG	2	6	22312	22317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010676	GCG	2	6	23268	23273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010676	GCGAC	2	10	23288	23297	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010676	CATCT	2	10	23564	23573	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010676	GAAGC	2	10	23593	23602	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010676	GTT	2	6	24663	24668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010676	CG	3	6	24676	24681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010676	GGC	3	9	24702	24710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010676	GC	3	6	24728	24733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010676	CAA	2	6	24735	24740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010676	CG	3	6	24743	24748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010676	CGG	2	6	24777	24782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010676	CG	3	6	24820	24825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010676	CGG	2	6	24847	24852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010676	TCC	2	6	29213	29218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010676	TC	3	6	29227	29232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010676	CGT	2	6	29238	29243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010676	ACG	2	6	29257	29262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010676	AGT	2	6	29286	29291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010676	GCA	2	6	31318	31323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010676	GCG	2	6	31343	31348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010676	G	6	6	31386	31391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010676	CG	3	6	31434	31439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010676	CCG	2	6	31456	31461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010676	AAGG	2	8	31489	31496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010676	GCCC	2	8	31586	31593	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_010676	TGAA	2	8	34503	34510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010676	TG	3	6	34513	34518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010676	TTG	3	9	34519	34527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010676	TTA	2	6	35803	35808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010676	GCA	2	6	35839	35844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010676	GCC	2	6	35853	35858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010676	GACG	2	8	35868	35875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010676	ATC	2	6	35897	35902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010676	GCA	2	6	35927	35932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010676	CCG	2	6	35945	35950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010676	CG	4	8	35949	35956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010676	GAC	2	6	35977	35982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010676	GCG	2	6	36005	36010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010676	GCG	2	6	36103	36108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010676	GC	3	6	36628	36633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010676	CCG	2	6	36647	36652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010676	TCA	2	6	36719	36724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010676	GCC	2	6	36726	36731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010676	GCGA	2	8	37629	37636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010676	GACA	2	8	37645	37652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010676	GAG	2	6	37655	37660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010676	GC	3	6	41068	41073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010676	GCG	2	6	41984	41989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010676	GTG	2	6	41995	42000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010676	AGCA	2	8	43185	43192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010676	CAT	2	6	43209	43214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010676	ATCG	2	8	43224	43231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010676	AGG	2	6	43282	43287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010676	CG	3	6	43543	43548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010676	CGG	2	6	43627	43632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010676	GA	3	6	43727	43732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010676	ATC	2	6	43760	43765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010676	TCG	2	6	43797	43802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010676	AAG	2	6	43806	43811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010676	TGCT	2	8	43818	43825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010676	CG	3	6	43871	43876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010676	GTT	3	9	44243	44251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010676	GA	3	6	44287	44292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010676	ACC	2	6	44296	44301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010676	TGTT	2	8	44313	44320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010676	ACAA	2	8	44333	44340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010676	CG	3	6	44361	44366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010676	GCA	2	6	44369	44374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010676	TCG	2	6	44392	44397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010676	TGC	2	6	45649	45654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010676	ACG	2	6	47210	47215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010676	CGG	2	6	47294	47299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010676	GGC	2	6	47306	47311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010676	CTGTC	2	10	47355	47364	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010676	CATG	2	8	47388	47395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010676	CAA	2	6	47396	47401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010676	ATT	2	6	47415	47420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010676	GCC	2	6	47746	47751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_010676	CAC	2	6	47759	47764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_010676	AG	3	6	47871	47876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010676	GC	3	6	47914	47919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010676	CGA	2	6	47938	47943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010676	AG	3	6	47947	47952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010676	CCA	2	6	47965	47970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_010676	GACG	2	8	47980	47987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010676	ATTCAA	2	12	47994	48005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_010676	GTT	2	6	48041	48046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_010676	GTGATA	2	12	49875	49886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_010676	GAC	2	6	54475	54480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_010676	TGC	2	6	58520	58525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_010676	CGAA	2	8	58582	58589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_010676	TCT	2	6	58743	58748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_010676	TGC	2	6	58752	58757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_010676	GCG	2	6	58793	58798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_010676	TG	3	6	58900	58905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_010676	TTCGT	2	10	117905	117914	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_010676	TAAA	2	8	117931	117938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_010676	CAC	2	6	118007	118012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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300	NC_010676	CG	3	6	120524	120529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
301	NC_010676	TGC	2	6	120573	120578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_010676	TCG	2	6	163154	163159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_010676	GC	3	6	163998	164003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
422	NC_010676	CG	3	6	164030	164035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
423	NC_010676	CATG	2	8	164040	164047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
424	NC_010676	GGC	2	6	164048	164053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_010676	GC	3	6	164052	164057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
426	NC_010676	CTC	2	6	164064	164069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
427	NC_010676	CGTAA	2	10	164080	164089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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429	NC_010676	GTC	2	6	165893	165898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_010676	GCC	2	6	166946	166951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_010676	TCG	2	6	166954	166959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_010676	CAA	2	6	166966	166971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_010676	ACC	2	6	171603	171608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_010676	GCC	2	6	171626	171631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_010676	GCG	2	6	172898	172903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_010676	GTT	2	6	172905	172910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010676	GGACG	2	10	172913	172922	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
453	NC_010676	CT	3	6	173019	173024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_010676	CGG	2	6	174373	174378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_010676	TTCG	2	8	174397	174404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_010676	TAC	2	6	174412	174417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_010676	GCG	2	6	176112	176117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_010676	GCG	2	6	176165	176170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_010676	GCC	2	6	176174	176179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_010676	GCG	2	6	179193	179198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_010676	CGT	2	6	179901	179906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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